
拜谱生物全新推出免疫肽组拜谱生物,通过MHC抗体阳性生物富集MHC下列不属于切合肽,使用Orbitrap Astral全新一代高分辨质谱仪检测,直接得到抗体肽编码序列各类译为后绘制图片信息,提高基因测序的真实度,并采用De novo重头测序技术工艺,不依赖现有数据库,极高通量鉴定出MHC上呈递的多肽,发现更多非典型免疫肽,而且多的数据研究研究玩法为医学研究中的新抗原鉴定、免疫治疗和疫苗开发提供支持。欢迎大家咨询!
图1 MHC-I和MHC-II呈递癌肿抗原的行业
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01 考核机制调查
原创文章题型:The nuclear export protein XPO1 provides a peptide ligand for natural killer cells
提出杂志网站:Science Advances IF:11.7 2024
XPO1 (Exportin-1/CRM1)是种核输出电压蛋白酶,在癌症复发中总是过展示,并且做好为癌症时有发生的带动客观因素。阶段,靶向疗法XPO1的小分子结构正被用于临床上防癌口服药物。作者发现XPO1是自然杀伤(NK)细胞的靶标。利用天然免疫肽组学,作者鉴定出一种衍生自XPO1的肽,它可以在人类白细胞抗原- C的背景下被激活的NK细胞受体KIR2DS2识别。该肽可以内源性加工并通过该受体特异性地激活NK细胞。虽然XPO1在癌症中的高表达通常与不良预后相关,但研究发现,如果有NK细胞浸润的证据,特异性癌症(如肝细胞癌)的预后可以大大改善。因此,作者确定XPO1是NK细胞识别的真正的肿瘤抗原,为NK细胞治疗实体瘤的个性化方法提供了机会。
图2 另外一种出于XPO1的肽是KIR2DS2的配体
02 癌症-免役中药治疗
篇文章一个题目:Development of mesothelioma-specific oncolytic immunotherapy enabled by immunopeptidomics of murine and human mesothelioma tumors
刊出杂志期刊:Nature Communications IF:16.6 2023
恶变胸膜间皮瘤(MPM)就也是种继发性不良的的侵蚀性恶性肿瘤。在共有的调理方案格式存在明确疗效,以至于迫切应该应该新的调理思路。因其其T细胞核浸润性,原作者有效市场理论MPM就也是个最合适的调理性胃癌役苗的任务。迄今为止,对间皮瘤的研究一直集中在识别分子标记以更好地对该疾病进行分类和表征,对涉及细胞毒性(CD8+) T细胞的治疗靶点知之甚少。在这项研究中,作者利用依托于质谱的免疫细胞肽组研究了小鼠(AB12细胞系)和人细胞系(H28、MSTO-211H、H2452和JL1)以及患者原发性肿瘤中MPM的抗原呈递景观。作者使用来自人类健康供体和癌症患者的T细胞体外表征了洗脱肽的免疫原性特征。此外,作者选择最有前景的肽搭配PeptiCRAd方法,在雌性小鼠的间皮瘤小鼠模型中测试其疗效。总的来说,作者证明了免疫肽组学分析与溶瘤免疫疗法相结合的使用代表了一种解决不可治疗肿瘤的可行且有效的策略。
图3 梭形细胞肿瘤胸膜间皮瘤天然免疫肽组学检查测量
03 病菌mRNA狂犬疫苗开发设计
短文题型:Immunopeptidomics-based design of mRNA vaccine formulations against Listeria monocytogenes
撤稿报纸:Nature Communications IF:16.6 2023
单核细胞增生李斯特菌是一种导致人类李斯特菌病的食源性细胞内细菌病原体。尽管死亡率高且抗生素耐药性增加,但仍没有临床批准的针对李斯特菌的疫苗可用。为了鉴定新的抗原,作者通过通过质谱的免疫力肽组学来筛选呈现在受感染的人类细胞系表面的李斯特菌肽。在超过15000种人类自身肽中,作者检测到来自42种不同细菌蛋白的68种李斯特菌免疫肽,包括几种已知抗原。呈现在不同细胞系上的肽通常来自相同的细菌表面蛋白,将这些抗原归类为潜在的候选疫苗。在脂质纳米粒mRNA疫苗制剂中编码这些高度呈递的抗原导致特异性CD8+ T细胞应答,并在小鼠的疫苗接种攻击实验中诱导保护。研究结果可以作为开发针对李斯特菌的临床mRNA疫苗的起点,证明了基于质谱的免疫肽组学在下一代细菌疫苗开发中的作用。
图4 在李斯特菌染上的Hela細胞和HCT-116細胞中司法鉴定MHC I呈递的抗原肽。
拜谱总结
抗体肿瘤上皮受损组织细胞力抗体性肽组学是淀粉酶质组学的是一个更快快速发展的分枝,它潜心于钻研抗体肿瘤上皮受损组织细胞力抗体性机系统中由最主要企业相匹配性结合体(MHC)或人类白肿瘤上皮受损组织细胞计数系抗原(HLA)大分子呈递的抗体肿瘤上皮受损组织细胞力抗体性肽。这抗体肿瘤上皮受损组织细胞力抗体性肽是肿瘤上皮受损组织细胞系外表面呈递的肽段,能被T肿瘤上皮受损组织细胞系设别,得以激发抗体肿瘤上皮受损组织细胞力抗体性化学反应。根据质谱的抗体肿瘤上皮受损组织细胞力抗体性肽组学逐渐已成为鉴别MHC淀粉酶呈递肽的金条件办法,能间接鉴别的区别生理学和方面的问题的情形下的区别企业和肿瘤上皮受损组织细胞系种类中的抗体肿瘤上皮受损组织细胞力抗体性肽组,随后小平面瘤或hiv病毒感柒的肿瘤上皮受损组织细胞系。拜谱生物作为国内领先的多组学公司,可提供完善成熟的核蛋白组学、代谢转化组学、转录组学等多组学产品技术服务体系。全新推出的免疫的检测肽组的检测仪器管理,通过MHC抗体特异性富集,高分辨质谱检测结合De novo从头测序技术,要为准且马上出示免役肽队列,遇到大量非其最典型的免役肽,一层层选择出不靠谱新抗原,有助于医学研究人员理解免疫系统的机制、开发疫苗、个性化癌症免疫疗法以及深入了解各种疾病的发病机制。
参考使用论文论文参考文献
1. Xie N,Shen G,Gao W, et al. Neoantigens: promising targets for cancer therapy. Signal Transduct Target Ther. 2023;8 (1):9. doi:10.1038/s41392-022-01270-x 2. Blunt MD,Fisher H,Schittenhelm RB, et al. The nuclear export protein XPO1 provides a peptide ligand for natural killer cells. Sci Adv. 2024;10 (34):eado6566. doi:10.1126/sciadv.ado6566 3. Chiaro J,Antignani G,Feola S, et al. Development of mesothelioma-specific oncolytic immunotherapy enabled by immunopeptidomics of murine and human mesothelioma tumors. Nat Commun. 2023;14 (1):7056. doi:10.1038/s41467-023-42668-7 4. Mayer RL,Verbeke R,Asselman C, et al. Immunopeptidomics-based design of mRNA vaccine formulations against Listeria monocytogenes. Nat Commun. 2022;13 (1):6075. doi:10.1038/s41467-022-33721-y