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网络药理学揭示草酸钙肾结石氧化应激和炎症损伤机制

发布时间:2024-08-02
草酸钙(CaOx)肾结石是泌尿体统最应见的急病之首。肾团队中CaOx结晶体过达到饱和状态积聚会致使肾小管神经元板材损害和凋亡,然而致使肾结石的建立。短链脂质酸由可以使肠胃内生物滤池病菌发效营养碳水化合物棉造成,这不仅在轮廓线可以使肠胃障壁中起着使用,甚至在体统技术上也起着关键点使用。之中,丁酸是最丰富性的短链脂质酸,具有着消除炎症和抗体抑制性使用,本深入分析研究方案丁酸对CaOx肾结石的使用简述暗藏靶点。

围绕草酸钙肾结石相关机制研究,华山诊所泌尿美容外科吴忠教学、周子健博士后于今年5月在Chem Biol Interact发表了相关成果,7月4日该团队又有一篇新作发表。吴忠专家教授、周子健院士在Food and Chemical Toxicology(IF=4.3)上发表题为“Butyric acid inhibits oxidative stress and inflammation injury in calcium oxalate nephrolithiasis by targeting CYP2C9”的研究文章。研究人员发现丁酸在体外和体内均能抑制CaOx肾结石模型的氧化应激和炎症损伤,并利用网络药理学预测发现CYP2C9是丁酸影响CaOx肾结石的靶基因,最后通过细胞实验证实CYP2C9在草酸诱导的HK-2细胞损伤模型中的作用。拜谱怪物与吴忠教授、周子健博士团队再次合作,提供了互联网药剂学学服务的,助力预测CYP2C9是丁酸影响CaOx肾结石的潜在靶点,为丁酸预防CaOx肾结石产生的临床应用奠定理论基础。

好的文章公司名称:Butyric acid inhibits oxidative stress and inflammation injury in calcium oxalate nephrolithiasis by targeting CYP2C9(Food Chem Toxicol.,IF=4.3,2023.07) 朋友公司:华山医阮 实验客体:大鼠、HK-2细胞膜 分成小组信息查询:剖析组(Con)、实体模型组(Model)和丁酸钠组(NaB) 拜谱提供了科技:无线网络药学学探测

想法具体步骤图

科研成果

理论研究方案人一方面建设大鼠类别,借助生理变化什么是生化要求和组织开展病理报告学染色剂等理论研究方案技术手段找到丁酸可能增多CaOx类别大鼠肾CaOx纳米线的组成和破损,提高CaOx类别大鼠的炎症病变破损和钝化杂质的适度表达出。除外,丁酸还可减缓草酸引诱的HK-2组织细胞膜破损、钝化应激反应和组织细胞膜凋亡。 为实验设计丁酸组成和靶人类dna无线互联网,探索人工从PubChem获利丁酸和丁酸酯的二维和三维图像组成(图1A)。实现PharmMapper数据表格显示信息库和Uniprot数据表格显示信息库开始处理后共淘汰出116个丁酸靶人类dna供进这一步讲解。将人类dna表单导出来STRING数据表格显示信息库,开始PPI无线互联网讲解。Cytoscape写出了排名的前20的核心区靶人类dna的简要无线互联网图,包含CYP2C9、CASP3、MAPK14、ALB、HRAS、ABL、RARA、RARG、RXRB、PRKACA、NOS3、SRC、MMP9、KDR、HSP90AA1、HPGDS、GSTA3、GSTA1、GSR和GSTM2(图1B)。这类核心区人类dna与无线互联网中的别人类dna均表面出务必的相关联内容性,说这类人类dna将切实更好地发挥着协同管理目的。GO和KEGG讲解阐述了丁酸核心区人类dna的相关联内容路线和菌物制品学工作(图1C)。核心区人类dna一般与类固醇的性激素回话、防氧化物应激发应性回话、渗透性氧血细胞对类固醇的性激素兴奋的生理响应、对偏酸菌物学杂质的生理响应相关的。所讲所讲,这类核心区人类dna一般加入了防氧化物应激发应性和对渗透性氧的菌物制品生理响应过程中 ,是肾结石出现考核机制中至关决定性的路线,这表述丁酸将在肾结石中切实更好地发挥决定性目的。

图1| 丁酸框架与靶基因组线上定量分析(图源:Zijian Zhou., et al., Food Chem Toxicol.

为进一点深入对其进行分析丁酸对CaOx肾结石真是切靶人类表观遗传,对其进行分析工作员利用GEO数值资料库对GSE73680中正常照表与CaOx肾结石患病者的人类表观遗传差异化来对其进行了对其进行分析。照表组与CaOx结石患病者的正一些性好异化描述方式人类表观遗传(DEGs)表观遗传检测标准为P < 0.05、|log2(FC)| > 1。共选择到3783个人类表观遗传发生了正一些变换,其中的3379个(89.4%)人类表观遗传描述方式上浮,404个(10.6%)人类表观遗传描述方式下跌(图2A)。对DEGs来对其进行聚类分析对其进行分析法对其进行分析,热图显视了前10个被选中DEGs的二维分类聚类分析对其进行分析法显著特点(图2B)。己经,对其进行分析工作员依据GeneCards数值资料库人工除理判定了370个应该与CaOx肾结石一些的人类表观遗传,斩获前20位的精准预测人类表观遗传还有其一些性评分表长为2C下图。为了能让找丁酸中药治疗CaOx肾结石的重点靶点,对其进行分析工作员将PharmMapper中的丁酸靶点、GEO中的DEGs和GeneCards中的CaOx肾结石一些人类表观遗传除理得到了了一大个Venn图。终究,CYP2C9被选定为丁酸引响CaOx肾结石的意向靶点(图2D)。凡此种种,对其进行分析工作员还来对其进行了丁酸与CYP2C9的分子结构协同工作,CYP2C9的多个安基酸残基ASN-474、LYS-48和GLY-46与丁酸间接功效,氢键能为4.2 kcal/mol(图2E)。 在回收利用网药理学学预測CYP2C9是丁酸会影响CaOx肾结石的靶表观遗传后,研究探讨人士还使用血肿瘤细胞调查灵魂存在了CYP2C9可降草酸促进的HK-2血肿瘤细胞的ROS平均水平、细菌感染挫伤和凋亡。

图2| 绝对多数据库合力进行分析分折CYP2C9是丁酸用处于CaOx肾结石的靶基因组

钻研毕竟

本科学研究先要找到丁酸在身体和体内的均能调控CaOx肾结石模形的阳极氧化反应应激状态性和支原体感染破损,第四按照网上药学学建立能够得到丁酸印象CaOx肾结石的潜在的靶点——CYP2C9,第四按照上皮细胞膜实践印证CYP2C9在草酸盐引诱的HK-2上皮细胞膜ROS水平面、支原体感染破损和凋亡。哪些找到阐明丁酸几率按照调控CYP2C9来调控CaOx肾结石的阳极氧化反应应激状态性,改善支原体感染破损。这一个工作中拜谱微菌物提供了了网上药学学技能精准服務,因此拜谱微菌物可加强旺盛期改善的DNA组学、核蛋白组学、分泌组学等多个学类产品及技能精准服務,欢迎大家致電资询! 选取文章:Zhou Z, Zhou X, Zhang Y, Yang Y, Wang L, Wu Z. Butyric acid inhibits oxidative stress and inflammation injury in calcium oxalate nephrolithiasis by targeting CYP2C9. Food Chem Toxicol. 2023 Aug. doi: 10.1016/j.fct.2023.113925.
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