
近日,苏州医科院校首先附设卫生院王学浩院士评选团对在Cancer Letters上发表了“O-GlcNAcylation of YBX1 drives a glycolysis-histone lactylation feedback loop in hepatocellular carcinoma”的研究论文。该研究建立了一个涉及YBX1糖酵解和H3K18乳酸化的正反馈循环,从而加速了HCC的进展。破坏这种反馈循环可能为HCC提供一种新的治疗策略。拜谱生物为该研究提供了转录组测序,蛋白酶互作组和靶向药物能量消耗代谢率检测分析服务。
日语一级标题:O-GlcNAcylation of YBX1 drives a glycolysis-histone lactylation feedback loop in hepatocellular carcinoma(Cancer Letters IF:10.1)
中文名问题:YBX1的O-乙酰葡糖胺化修饰驱动肝细胞癌中糖酵解-组蛋白乳酸化反馈环路
客服组织:南京医科大学
研究分析的原材料:细胞
拜谱提拱工作:转录组测序+蛋白酶互作组+靶向治疗能源分泌组
水平自驾线路:
分析毕竟
01、YBX1被司法鉴定为HCC中糖酵解的重要的dna
本研究方案提取HCC恶性癌肿模板(n=7)的单神经受损细胞系RNA测序数剧集来进行定性分析一下,表明糖酵解活性酶类重点聚集在恶性癌肿神经受损细胞系中,hdWGCNA进行定性分析一下判断出9个dna模组(图1A-G)。TCGA-LIHC列队的繁衍进行定性分析一下判断YBX1为自己繁衍危险 问题(图1H)。进步骤融合IHC、WB实验英文和恶性癌肿策划 与挨近非恶性癌肿策划 的个人空间转录组学数剧集印证YBX1是肝神经受损细胞系癌的治疗的因素靶点(图1I-K)。
图1:YBX1被判别为调控HCC内部糖酵解的要点因素
02、YBX1推动HCC中的有氧糖酵解和分裂繁殖
为了研究YBX1在调控HCC糖酵解中的作用。构建YBX1敲低细胞系,靶向药物势能分解代谢组学检测,敲低后糖酵解途径的几个关键中间体显著减少,三羧酸(TCA)循环中间体的水平也降低了(图2A-D);结合葡萄糖碳示踪法、细胞外酸化率检测等实验证实YBX1敲低后,糖酵解活性受损,葡萄糖摄取和乳酸分泌减少,抑制HCC细胞增殖(图2E-K)。
图2:YBX1有利于促进HCC中的有氧糖酵解和繁殖
03、OGT与YBX1融合并有利于YBX1的O-GlcNAc糖基化
为了识别YBX1的调控因子,蛋白质互作组分析显示YBX1与O-GlcNAc转移酶(OGT)相互作用,并结合Co-IP和共定位进行验证(图3A–E)。进一步创建了一个OGT K908A突变体,利用O-GlcNAc糖基化激活剂、抑制剂OSMI-1判断YBX1的O-GlcNAc糖基化的变化(图3F-H),结构域分析OGT的TPR结构域对于与YBX1的结合至关重要(图3I-L)。免疫沉淀YBX1的质谱分析揭示了六个潜在的O-GlcNAc糖基化位点,并结合点突变和分析证实T57是YBX1上关键的O-GlcNAc糖基化位点(图3M-O)。
图3:OGT与YBX1相结合并力促YBX1的O-GlcNAc糖基化
04、YBX1的O-GlcNAc糖基化提升其磷硝化作用,而力促其核转位
进十步检验YBX1的O-GlcNAc糖基化要不要会影响其磷硝化作用,在OGT敲低的HCC生殖细胞核中或用OGT可以抑药物OSMI-1加工,YBX1蛋白酶酶质横向面不错消减,YBX1磷硝化作用不错抑制(图4A-C)。IP调查显视,在完全相同的Flag-YBX1底物横向面下,YBX1-WT的磷硝化作用横向面不错超出YBX1-T57A,表面磷硝化作用的不断增加不也是仅是因此挺高的YBX1蛋白酶酶质描述(图4D)。转移了核和质类物质发展TMG加工的HCC生殖细胞核中YBX1核描述的增加(图4E-F),进十步发展YBX1磷硝化作用的重要调整指数是AKT(图4G-I)。某些发展突出O-GlcNAc糖基化能够有助于会其磷硝化作用来明显增强YBX1蛋白酶酶质稳固性并有助于会核转位。
图 4.YBX1的 O-GlcNAc 淡化语优势于其进一个步骤发生的磷酸性反应淡化语并都可以利于其核转位
05、YBX1驱动PKM2转录
前期结果表明YBX1 O-GlcNAc糖基化通过增强糖酵解和细胞增殖促进HCC进展。为了研究YBX1如何调控糖酵解,我们在HCC细胞中进行了转录组测序分析,糖酵解相关基因集在YBX1敲低细胞中显著抑制(图5A-B)。RNA 测序数据和 CUT&Tag 数据集以及ChIP-qPCR、QRT-PCR 分析表明PKM2 和 LDHA 是 YBX1 的直接转录靶标(图5C-H)。
图 5.YBX1提高网站PKM2转录
06、YBX1 就能挺高组蛋白酶乳酸性反应体现水平面
科研知道YBX1敲低差异性变低蛋白质酶质乳过酸,尤其要是H3K18乳过酸(图6A-C)。糖酵解促使剂2-DG的实践印证了糖酵解与组蛋白质酶乳过酸的可以可以绑定,促使糖酵解可差异性变低H3K18la含量(图6D)。PKM2过描述可逆性转YBX1敲低所导致的的H3K18la增涨,到外源乳酸整理不但改善H3K18la,还还会伴有YBX1描述上浮,报错会存在正面评价(图6E-G)。CUT&Tag与ChIP-PCR印证,H3K18la采用聚集于YBX1运行子可以可以有助于其转录,该期间受O-GlcNAc糖基化政策调控(图6H-J),并知道P300 上浮是YBX1改善H3K18乳酰化成用的工作机制(图6K-L)。
图6.YBX1明显增强H3K18乳过酸淡化标准
小文章总结
在这方面研究探讨中宣传报道了YBX1在HCC中高体现方法,还有与糖酵解密码切各种相关联。YBX1在T57处被O-GlcNAc绘制,然而稳定可靠球高淀粉酶并加大其体现方法。此种绘制还驱动软件YBX1在T57处的磷过酸,驱动软件其核易位。由于,相应历程激发了糖酵解各种相关联染色体的转录并刺激性乳酸的引发。显然,YBX1成功激活P300的转录,借以驱动软件组球淀粉酶的乳过酸,特意是H3K18la,H3K18乳过酸双向调节管控YBX1染色体转录(图7)。
图7.Y糖酵解-表观遗传基因正反两面馈环缘由图
拜谱总结
本研究结合了单细胞转录组、空间转录组的数据,利用转录组、蛋白互作组、代谢组以及多种分子实验揭示了一个YBX1-糖酵解-H3K18la 的反馈回路,驱动HCC进展,并提示针对HCC代谢的潜在治疗策略。拜谱生态学为该研究提供了转录组测序,蛋清互作组和靶向药物能量场排泄组技术服务,拜谱怪物建立了完善成熟的转录组学、蛋清组学、译为后修饰语组学、基础代谢组学以及多组学联合产品技术服务体系,助力发表高分文献,欢迎致电咨询!
参阅论文论文参考文献
Ji Y, Xu Z, Tang L, Huang T, et,al.. O-GlcNAcylation of YBX1 drives a glycolysis-histone lactylation feedback loop in hepatocellular carcinoma. Cancer Lett. 2025 Oct 28;631:217957. doi: 10.1016/j.canlet.2025.217957. Epub 2025 Jul 26. PMID: 40721081.